Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms