Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HSPB3Q12988 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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