Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXF2Q12947 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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