Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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