Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YPR203WYPR203W 309 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 RXT2YBR095C 1293 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YCL002CYCL002C 792 nt3.2□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YMR046CYMR046C 1323 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 CST9YLR394W 1449 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 CDC37YDR168W 1521 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 NOP56YLR197W 1515 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 SEC26YDR238C 2922 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 RSM18YER050C 417 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 PRP38YGR075C 729 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 JIP3YLR331C 378 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 DGA1YOR245C 1257 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 LOA1YPR139C 903 nt3.19□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 ARP5YNL059C 2268 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 VAB2YEL005C 849 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 HMF1YER057C 390 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YFL015CYFL015C 495 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 MST27YGL051W 705 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 UPF3YGR072W 1164 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 GOS1YHL031C 672 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 NNT1YLR285W 786 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 FAR3YMR052W 615 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 NAB3YPL190C 2409 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 STE6YKL209C 3873 nt3.18□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YAT2YER024W 2772 nt3.17□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.17□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 LOC1YFR001W 615 nt3.17□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 ERP6YGL002W 651 nt3.17□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 TAD1YGL243W 1203 nt3.17□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YGR160WYGR160W 612 nt3.17□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YJR020WYJR020W 333 nt3.17□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YBL028CYBL028C 321 nt3.17□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 ATP11YNL315C 957 nt3.17□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 DYN1YKR054C 12279 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 ARG2YJL071W 1725 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 SRP1YNL189W 1629 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 NFT1YKR103W 3657 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 SNO3YFL060C 669 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YKL115CYKL115C 393 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 ATG10YLL042C 504 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 ATG38YLR211C 681 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 AAR2YBL074C 1068 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 SNO2YNL334C 669 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 TPK2YPL203W 1143 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YBP2YGL060W 1926 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 ECM29YHL030W 5607 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 SLH1YGR271W 5904 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 TRM82YDR165W 1335 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 YNL011CYNL011C 1335 nt3.16□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 PIN4YBL051C 2007 nt3.15□□□□□ -1.9
LSP1Q12230 PUF6YDR496C 1971 nt3.15□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 NSE4YDL105W 1209 nt3.15□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RPL23BYER117W 414 nt3.15□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RPS23AYGR118W 438 nt3.15□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SYS1YJL004C 612 nt3.15□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YJL114WYJL114W 681 nt3.15□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 PRM6YML047C 1059 nt3.15□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RPS23BYPR132W 438 nt3.15□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SEC15YGL233W 2733 nt3.15□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 VPS9YML097C 1356 nt3.14□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 UBP8YMR223W 1416 nt3.14□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 BRR6YGL247W 594 nt3.14□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.14□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 VPS20YMR077C 666 nt3.14□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YNR062CYNR062C 984 nt3.14□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SGT1YOR057W 1188 nt3.14□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 DPB3YBR278W 606 nt3.14□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SAP1YER047C 2694 nt3.14□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 MOT1YPL082C 5604 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 VAC14YLR386W 2643 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 AEP1YMR064W 1557 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RPA190YOR341W 4995 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 KEI1YDR367W 666 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 MND1YGL183C 660 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RPL27AYHR010W 411 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 CKA1YIL035C 1119 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SDS22YKL193C 1017 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YLR202CYLR202C 327 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 PEX11YOL147C 711 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 HHF1YBR009C 312 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 LCL1YPL056C 306 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YPL068CYPL068C 882 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 MUD1YBR119W 897 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 CHS3YBR023C 3498 nt3.13□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YGR237CYGR237C 2358 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 ATP25YMR098C 1839 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 NRG1YDR043C 696 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 GRX2YDR513W 432 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 COG2YGR120C 789 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 EFG1YGR271C-A 702 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 PRP21YJL203W 843 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 TPK3YKL166C 1197 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 MST28YAR033W 705 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SRL1YOR247W 633 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 ADF1YCL058W-A 342 nt3.12□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 PSY4YBL046W 1326 nt3.12□□□□□ -1.91
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