Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPAL4Q0D2K0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms