Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPAQ06546 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms