Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE1BQ01064 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE1BQ01064 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms