Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFI35P80217 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IFI35P80217 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFI35P80217 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFI35P80217 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFI35P80217 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFI35P80217 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFI35P80217 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFI35P80217 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFI35P80217 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFI35P80217 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFI35P80217 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFI35P80217 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFI35P80217 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFI35P80217 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFI35P80217 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFI35P80217 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFI35P80217 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms