Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRX1P78414 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRX1P78414 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRX1P78414 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRX1P78414 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRX1P78414 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRX1P78414 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRX1P78414 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRX1P78414 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms