Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPFP62306 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms