Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP46P62068 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP46P62068 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP46P62068 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP46P62068 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP46P62068 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP46P62068 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP46P62068 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP46P62068 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP46P62068 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP46P62068 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP46P62068 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP46P62068 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP46P62068 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP46P62068 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms