Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P61576 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P61576 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms