Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVFC1-1P60608 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms