Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YLR050CYLR050C 486 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 PEX27YOR193W 1131 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 ITT1YML068W 1395 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 PTP3YER075C 2787 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 FLO1YAR050W 4614 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 RMD6YEL072W 696 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YEL075CYEL075C 369 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 COBQ0105 1158 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YNL276CYNL276C 396 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YNR062CYNR062C 984 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YOR152CYOR152C 771 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 POP7YBR167C 423 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YBP2YGL060W 1926 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 SRP1YNL189W 1629 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 SMC2YFR031C 3513 nt3.26□□□□□ -1.89
HEF3P53978 STT4YLR305C 5703 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 ERG9YHR190W 1335 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 CDC37YDR168W 1521 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 RAD18YCR066W 1464 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 HTA1YDR225W 399 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 PEX10YDR265W 1014 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 PNC1YGL037C 651 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YGL109WYGL109W 324 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 OST6YML019W 999 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YNR025CYNR025C 360 nt3.25□□□□□ -1.89
HEF3P53978 HAA1YPR008W 2085 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 TCP1YDR212W 1680 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 INP52YNL106C 3552 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 snR68snR68 136 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 SPT2YER161C 1002 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 UPF3YGR072W 1164 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YJL114WYJL114W 681 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YKL123WYKL123W 381 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YLR400WYLR400W 474 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YLR416CYLR416C 399 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 FAR3YMR052W 615 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 AAR2YBL074C 1068 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 DPB3YBR278W 606 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 DUN1YDL101C 1542 nt3.24□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YMR046CYMR046C 1323 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 UBC13YDR092W 462 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 GRX2YDR513W 432 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 PGD1YGL025C 1194 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 BRR6YGL247W 594 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 RPS23AYGR118W 438 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 AIM19YIL087C 474 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YPT52YKR014C 705 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 ATG10YLL042C 504 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 RPS23BYPR132W 438 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 VIP1YLR410W 3441 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 NOP56YLR197W 1515 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 IRC3YDR332W 2070 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 APC5YOR249C 2058 nt3.23□□□□□ -1.89
HEF3P53978 ROM1YGR070W 3468 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 HMO1YDR174W 741 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 RPL1BYGL135W 654 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 LIN1YHR156C 1023 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 CAP1YKL007W 807 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 TSR4YOL022C 1227 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 RPL1AYPL220W 654 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YBR063CYBR063C 1215 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 RXT2YBR095C 1293 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 snR24snR24 89 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 SNQ2YDR011W 4506 nt3.22□□□□□ -1.89
HEF3P53978 TRM82YDR165W 1335 nt3.21□□□□□ -1.89
HEF3P53978 AEP1YMR064W 1557 nt3.21□□□□□ -1.89
HEF3P53978 ENA5YDR038C 3276 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YDR248CYDR248C 582 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YFH7YFR007W 1062 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 TAD1YGL243W 1203 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 GOS1YHL031C 672 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 AIM18YHR198C 966 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YKL115CYKL115C 393 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YBL065WYBL065W 345 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 BRX1YOL077C 876 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 CDH1YGL003C 1701 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 SPO71YDR104C 3738 nt3.21□□□□□ -1.9
HEF3P53978 TPO5YKL174C 1857 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 REF2YDR195W 1602 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 ARP5YNL059C 2268 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 NRG1YDR043C 696 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YGR226CYGR226C 210 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 RPA12YJR063W 378 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 IME1YJR094C 1083 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 HHF1YBR009C 312 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 SRL1YOR247W 633 nt3.2□□□□□ -1.9
HEF3P53978 snR43snR43 209 nt3.2□□□□□ -1.9
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