Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC5A3P53794 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC5A3P53794 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms