Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP4P49662 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP4P49662 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP4P49662 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP4P49662 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP4P49662 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP4P49662 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP4P49662 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP4P49662 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP4P49662 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP4P49662 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP4P49662 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP4P49662 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP4P49662 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP4P49662 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP4P49662 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms