Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN1P49257 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms