Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIP4K2AP48426 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIP4K2AP48426 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms