Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGCXP38435 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGCXP38435 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGCXP38435 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GGCXP38435 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGCXP38435 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGCXP38435 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGCXP38435 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGCXP38435 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GGCXP38435 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GGCXP38435 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GGCXP38435 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGCXP38435 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GGCXP38435 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GGCXP38435 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GGCXP38435 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms