Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TGFBR1P36897 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms