Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACVR1BP36896 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms