Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms