Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP7BP35670 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms