Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CPS1P31327 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPS1P31327 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPS1P31327 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPS1P31327 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CPS1P31327 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPS1P31327 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CPS1P31327 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPS1P31327 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPS1P31327 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPS1P31327 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPS1P31327 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CPS1P31327 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPS1P31327 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPS1P31327 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPS1P31327 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CPS1P31327 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPS1P31327 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CPS1P31327 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CPS1P31327 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CPS1P31327 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPS1P31327 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPS1P31327 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CPS1P31327 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPS1P31327 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CPS1P31327 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPS1P31327 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPS1P31327 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPS1P31327 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPS1P31327 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPS1P31327 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPS1P31327 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPS1P31327 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CPS1P31327 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CPS1P31327 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPS1P31327 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CPS1P31327 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CPS1P31327 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPS1P31327 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms