Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA11P31270 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA11P31270 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms