Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms