Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRYBB3P26998 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYBB3P26998 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms