Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM3P25205 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM3P25205 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM3P25205 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCM3P25205 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCM3P25205 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCM3P25205 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms