Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLP19338 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLP19338 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLP19338 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLP19338 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLP19338 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLP19338 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLP19338 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLP19338 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLP19338 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLP19338 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLP19338 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCLP19338 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCLP19338 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCLP19338 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCLP19338 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCLP19338 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCLP19338 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCLP19338 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCLP19338 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCLP19338 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCLP19338 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCLP19338 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLP19338 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLP19338 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms