Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF3P18847 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF3P18847 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF3P18847 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF3P18847 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF3P18847 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF3P18847 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF3P18847 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF3P18847 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF3P18847 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF3P18847 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF3P18847 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF3P18847 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF3P18847 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF3P18847 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF3P18847 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF3P18847 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF3P18847 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF3P18847 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF3P18847 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF3P18847 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF3P18847 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF3P18847 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF3P18847 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF3P18847 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF3P18847 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF3P18847 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF3P18847 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF3P18847 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF3P18847 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF3P18847 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF3P18847 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms