Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms