Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MUC1P15941 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MUC1P15941 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MUC1P15941 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MUC1P15941 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MUC1P15941 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MUC1P15941 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MUC1P15941 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MUC1P15941 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUC1P15941 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUC1P15941 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUC1P15941 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUC1P15941 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUC1P15941 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUC1P15941 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUC1P15941 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUC1P15941 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MUC1P15941 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUC1P15941 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUC1P15941 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUC1P15941 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUC1P15941 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MUC1P15941 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUC1P15941 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUC1P15941 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUC1P15941 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MUC1P15941 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MUC1P15941 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MUC1P15941 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MUC1P15941 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MUC1P15941 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MUC1P15941 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MUC1P15941 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MUC1P15941 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MUC1P15941 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms