Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms