Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RALAP11233 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RALAP11233 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RALAP11233 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RALAP11233 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RALAP11233 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RALAP11233 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RALAP11233 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RALAP11233 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RALAP11233 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RALAP11233 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RALAP11233 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALAP11233 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALAP11233 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALAP11233 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALAP11233 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALAP11233 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALAP11233 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALAP11233 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RALAP11233 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms