Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3P10147 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3P10147 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3P10147 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3P10147 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3P10147 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms