Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMIGD3P0DMS9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms