Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPSAP08865 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPSAP08865 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPSAP08865 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPSAP08865 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPSAP08865 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPSAP08865 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPSAP08865 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPSAP08865 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPSAP08865 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPSAP08865 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPSAP08865 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPSAP08865 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPSAP08865 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPSAP08865 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPSAP08865 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPSAP08865 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPSAP08865 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms