Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRCP08575 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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