Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTMAP06454 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTMAP06454 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTMAP06454 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTMAP06454 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTMAP06454 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTMAP06454 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms