Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC1P02654 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOC1P02654 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
APOC1P02654 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC1P02654 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC1P02654 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC1P02654 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC1P02654 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC1P02654 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC1P02654 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms