Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD4O95243 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD4O95243 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD4O95243 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD4O95243 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD4O95243 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD4O95243 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD4O95243 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD4O95243 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD4O95243 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD4O95243 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD4O95243 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD4O95243 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD4O95243 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD4O95243 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD4O95243 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD4O95243 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD4O95243 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms