Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP9O75884 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP9O75884 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms