Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMUO75648 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMUO75648 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMUO75648 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMUO75648 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMUO75648 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMUO75648 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMUO75648 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMUO75648 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMUO75648 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMUO75648 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMUO75648 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMUO75648 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRMUO75648 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRMUO75648 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRMUO75648 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms