Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F6O75461 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F6O75461 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F6O75461 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F6O75461 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F6O75461 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F6O75461 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F6O75461 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms