Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA3O75145 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms