Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP9AO75110 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9AO75110 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms