Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B3O60423 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B3O60423 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms