Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRXO43186 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRXO43186 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRXO43186 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRXO43186 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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