Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF113AO15541 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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